Sin Copa ni Playoff por primera vez desde la temporada 1988-89
Fernando Bermúdez sigue en la presidencia con José Asensio como director deportivo. Continúa Pedro Martínez aunque, como veremos, no por mucho tiempo.
Se incorpora a Aspe, Garnett, José López Valera, Nikolic, Sergio Sánchez (que estaba cedido en Fuenlabrada) y el georgiano Viktor Sanikidze. Entre Miso y Mendiburu se prefiere a este último; Miso parte hacia Fuenlabrada que le firma dos años pero le traspasa al año siguiente a Sevilla.
Aspe no juega y José López apenas un par de minutos en toda la temporada. La figura del fichaje que no juega será casi una constante en los próximos años.
Poco duraría la etapa de Pedro Martínez. En febrero, tras perder 10 de los últimos 11 partidos, Pedro Martínez es destituido y Mariano de Pablos toma el relevo.
En abril se juega la Final Four de la FIBA Eurocup en Girona; con mucha diversión en la grada pero ninguna victoria en la cancha.
El Estu es 9º al final de la liga regular con un balance de 16 victorias frente a 18 derrotas.
Por primera vez en 17 años no se juega Copa ni Playoff.
Hasta ese momento se había participado en 21 de las 23 ediciones de la Copa ACB; de ahora en adelante será una rareza: solo dos clasificaciones y otras tantas invitaciones como anfitrión.
Plantilla 2006-07
Esta temporada formaron la plantilla los siguientes jugadores:
- Daniel Clark
- Alberto Aspe
- Viktor Sanikidze
- Marlon Garnett
- Pancho Jasen
- Iker Iturbe
- José López Valera
- Gonzalo Martínez
- G. Nikolic
- Javier Mendiburu
- Sergio Sánchez
- Caio Torres
- Javi Beirán
- Yannick Driesen
- Will McDonald
- Carlos Suárez
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